Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEC11CQ9BY50 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms