Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms