Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD6Q9BRQ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD6Q9BRQ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms