Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDF4Q9BRK5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF4Q9BRK5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms