Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms