Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGIP1Q9BQI5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms