Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms