Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF1Q99551 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF1Q99551 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF1Q99551 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF1Q99551 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTERF1Q99551 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF1Q99551 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms