Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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