Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA3Q96KX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms