Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms