Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC127Q96BQ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms