Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX2-3Q8TAU0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms