Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL22A1Q8NFW1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL22A1Q8NFW1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL22A1Q8NFW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms