Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPRC5AQ8NFJ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPRC5AQ8NFJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPRC5AQ8NFJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms