Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC197Q8NCU1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC197Q8NCU1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms