Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms