Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A9Q8IVB4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms