Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNL1Q8IU54 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms