Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM2Q86SE8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms