Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms