Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC46A3Q7Z3Q1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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