Protein–RNA interactions for Protein: Q7L014

DDX46, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX46Q7L014 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX46Q7L014 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX46Q7L014 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms