Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFAP47Q6ZTR5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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