Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC73Q6ZRK6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC73Q6ZRK6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms