Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP12Q6UXS9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP12Q6UXS9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms