Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHISA2Q6UWI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHISA2Q6UWI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms