Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC3HQ6NTF7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms