Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1Q6GMV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1Q6GMV3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms