Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX8Q68G74 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX8Q68G74 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms