Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms