Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RSBN1Q5VWQ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms