Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF3Q5VWG9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF3Q5VWG9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms