Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf50Q5SZB4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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C9orf50Q5SZB4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf50Q5SZB4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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