Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SNAPC4Q5SXM2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNAPC4Q5SXM2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNAPC4Q5SXM2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNAPC4Q5SXM2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNAPC4Q5SXM2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms