Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms