Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms