Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF4BQ2VIQ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms