Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V1FQ16864 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V1FQ16864 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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