Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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NRF1Q16656 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NRF1Q16656 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NRF1Q16656 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NRF1Q16656 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NRF1Q16656 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRF1Q16656 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRF1Q16656 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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