Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK4Q16654 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PDK4Q16654 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK4Q16654 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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