Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAM1Q15629 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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