Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRADDQ15628 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms