Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACAP1Q15027 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAP1Q15027 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms