Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERPUD1Q15011 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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