Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE4AQ14139 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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UBE4AQ14139 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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UBE4AQ14139 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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UBE4AQ14139 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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UBE4AQ14139 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE4AQ14139 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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