Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4BQ13620 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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