Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PEX6Q13608 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PEX6Q13608 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PEX6Q13608 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PEX6Q13608 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PEX6Q13608 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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