Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNW1Q13573 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms