Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LSAMPQ13449 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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